澎湖南方四島的部分,因為鄰近漁業的資源保護區、種原庫及保護珊瑚礁生態的部分,像生態保護區及特別景觀區是禁止水域遊憩活動,但是其他區域如澎湖南方四島園區的一般管制區跟遊憩區均是免經申請,可以從事非動力性質的水上活動。
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