海巡的部分,目前已經有設置了一些岸際雷達,有涵蓋到南方四島國家公園的海域。另外,針對大陸漁船的部分,在海象轉列前會實施超前佈署,先期於澎湖南方跟北方海域佈署巡防艦各1艘,也有規劃50噸艇會在該海域巡弋勤務。